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株式譲渡と事業譲渡の違い|売り手・買い手の視点で比較

株式譲渡は会社の持ち主が変わる手法で、事業譲渡は事業の一部または全部を選んで売買する手法です。売り手の立場と税金、リスクが異なります。この記事では両者を比較し、選ぶ基準を説明します。

株式譲渡と事業譲渡の違い

株式譲渡は株主が会社の株式を売り、会社そのものはそのまま残ります。事業譲渡は会社が事業を売り、資産や契約を個別に移します。

株式譲渡事業譲渡
売り手株主(オーナー個人など)会社
対価を受け取る人株主会社
引き継ぐ範囲会社全体(負債や契約を含む)選んだ事業・資産のみ
手続き比較的簡単契約、許認可、雇用を個別に移す
買い手のリスク簿外債務も引き継ぐおそれ範囲を絞りやすい
売り手に残るもの会社は手元から離れる会社と残りの事業が残る

税金の違い

税金の扱いは手法によって大きく変わります。以下は一般的な説明で、実際の計算は個別の事情によります。

  • 株式譲渡(個人の株主):譲渡所得として、原則20.315%(所得税、復興特別所得税、住民税)が課税されます
  • 事業譲渡:売り手の会社の利益として法人税等の対象です。資産の内容によって消費税も関わります

対価が会社に入るか個人に入るかで、その後の資金の使い道も変わります。手取りを比べるときは、税理士に試算を依頼しましょう。

どちらを選ぶかの判断基準

状況検討しやすい手法
オーナーが引退し、会社ごと引き継ぎたい株式譲渡
不採算事業を手放し、本業を残したい事業譲渡
Web事業やECサイトだけを売りたい事業譲渡(会社分割も検討)
簿外債務のリスクを避けて買いたい事業譲渡
許認可や多くの契約をそのまま使いたい株式譲渡

許認可は手法で扱いが変わるため、早めに確認が必要です。取引先との契約には、株主の変更を通知事由にしている条項もあります。

Web事業を切り出すときの注意点

Web事業の事業譲渡では、譲渡の対象を一覧にすることが大切です。漏れやすいのは次のものです。

  • ドメイン、サーバー、CMSの管理権限
  • GA4、Search Console、広告アカウント
  • コンテンツや画像の著作権、商標
  • ECモールや決済サービスの契約(承継の手続きが必要なものがあります)
  • SNSアカウント(規約で譲渡を禁じているサービスがあります)

Web資産の調べ方はWeb DDの解説をご覧ください。

よくある質問

中小企業ではどちらが多いですか。

会社全体の承継では、手続きが比較的簡単な株式譲渡が検討されることが多くあります。事業の一部を切り出すなら事業譲渡が適しています。

従業員はどうなりますか。

株式譲渡では雇用契約はそのまま続きます。事業譲渡では、従業員の同意を得て移す手続きが必要です。

会社分割との違いは何ですか。

会社分割は事業を別の会社に包括的に承継させる手法で、個別の移転手続きを減らせることがあります。要件と税務は専門家にご確認ください。

まとめ

株式譲渡と事業譲渡の違いを、売り手、対象範囲、税金、引き継ぎの手間、リスクの面から比較します。中小企業のM&Aで選ぶときの判断基準がわかります。

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この記事は一般的な情報の提供を目的としています。個別の税務や法務の判断は、税理士や弁護士にご確認ください。

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代表の重富は2026年7月に株式会社Briaを買収。買い手の迷いを当事者として知っています。

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